Bonjour,
Si:
- tout fonctionnait très bien, que les problèmes ont commencé brutalement sans intervention au niveau du site (c'est bien le cas? pas d'installation de plugin, de templates, etc?)
- que des permissions de fichiers changent toutes seules (644 -> 444): ça se passe au niveau du serveur ça
- que d'autres extensions que sh404SEF sont affectées de la même manière (cache)
il ne semble pas que sh404SEF puisse avoir quelque chose à voir là-dedans, à part subir.
Comme le pb semble être apparu brutalement, la cause la plus fréquente est une mise à jour du système du serveur (PHP, modification des règles du Suhosin patch si utilisé, apache le cas échéant).
Il faut aussi vérifier malgré tout en interne, que les plugins systèmes et autres de sh404SEF ne sont pas désactivés.
Cordialement