Bonjour peric22 et bienvenue
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Le fait de migrer un template vers sa version 2.5 peut avoir des répercussions sur ses fonctionnalités notamment sur l'administration du template.
Tu peux en effet intervenir sur le fichier index.php pour procéder à des modifications mais jette plutôt un oeil aux CSS pour la personnalisation des couleurs.
Concernant swMenuFree, il faut que tu repères avec Firebug la ligne CSS appliquant la couleur de police au menu.